家犬起源自东亚,这一地区存有许多古老的品种犬。不同于近代才形成品种的欧洲地区的品种犬,东亚地区的品种犬历史悠久,近期没有经历严重的瓶颈效应,并且品种内具有较高的避传多样性和许多独特的表型。为此,昆明动物所张亚平课题组的研究人员采用一种基于二代测序和酶切简化基因组技术的低成本测序方法一一限制性酶切位点 DNA 测序法(restrietion-site associated DNA sequencing, RAD-sea),对采自中国地区的9只松狮犬的基因组进行了简化测序。项目组将这一数据与之前己发表的包括4只灰狼、33只家犬的全基因组测序数据,以及包含 1191 只犬科样品的全基因组 SNP 芯片数据相结合,利用主成分分析,群体结构分析以及系统发育分析等分析手段,发现松狮大与沙皮犬、秋田犬等东亚的品种犬同展于东亚地区的一个古老分支。在本研究包含的所有家犬群体中,松狮大与中国土狗的分歧时间进行的估计表明,与土狗的关系最为密切。作者同时对松狮大基因组中可能受到选择的位点进行了检测,发现其基因组中与消化和代谢相关的基因,以及与肌肉形成和心脏发育相关的基因受到人工选择的作用。这一研究工作首次对东亚地区古老品种犬的起源进行了系统研究,为未来这一方向的研充奠定了坚实基础、提供了重要参考。